不少農戶雖逐漸重視了生物肥的使用，但只知道施， 卻不知道在施用后如何使其快速繁殖，致使土壤中施入的生物菌活動能力弱，生存率低，效果差。那么，生物菌在施入土壤后怎樣才能使其發揮出應有的作用呢？生物菌施入土域后貴在“養”。
首先，生物菌施入土域后要為其創造一個好的生存壞境。
如何來創造一個好的生存環境呢？ 主要應做到以下幾點：一是要調控好棚內的地溫。一般菌肥中的生物菌在18- 25℃時生命活動最為活躍， l5℃以下時生命活動開始降低，10℃以下時活動能力已很微弱，甚至處于休眠狀態。
要想調控好地溫，首先要調控好翻內氣溫，一般棚內氣溫白天應保持在25- 30℃，夜間棚內溫度低，為避免地溫散失，維持地溫恒定，除了采取地膜覆蓋外 在操作行內覆蓋作物秸稈也不失為一種好辦法。二是要調控好土壤的濕度。土壤含水量不足不利于生物菌的生長繁殖，但土壤在澆水過大，透氣性不良，含氧量較少的情況下也不利于生物菌的生存，因為生物菌大都是好氧性，一般在土壤見干見濕時生物菌的生命活動最為活躍。因此，除調控好地溫外，合理澆水也是一個重要的因素。一般情況下，澆水應選在晴天的上午進行，因這段時間內澆水有利于地溫的恢復和棚內濕氣的排除。澆水時要注意澆小水，切忌大水漫灌，澆水后應及時劃鋤，以增加土壤透氣性，促進生物菌的生命活動。
其次，要為生物菌提供充足的“食物”。
生物菌是活的生物，它也需要“吃飯”。因此，充足的食物是生物菌存活的基礎。在很多大棚區，菜農不注重雞糞等有機肥的施用，棚內土壤有機質含量嚴重貧乏，個別地區有機質含量還不是l%。土壤中的生物菌長時間得不到食物，存活都成問題，如何來為我們工作呢？因此.蔬菜定植前，一定要注意施足有機肥，一般每畝菜地以施純雞糞15- 20方或稻売糞30-40方為宜。
再次要盡量避免生物菌受到傷害。
生物菌最怕殺菌劑，而不少菜農為防蔬菜根部病害常用殺菌劑灌根，這無疑使剛剛在土壤中定居的生物菌遭受滅頂之災。另外，大量地沖施化肥對土壤中生物菌的傷害也很大 。因此，對于施用生物菌肥的大棚地，應盡量避免使用殺菌劑灌根，少施化學肥料 。
另外生物菌対土壤的酸堿度也有要求。
土壤偏堿或偏酸都不利于生物菌的生長繁殖。一般情況下土壤PH值在6.5- 7.5之間時最適合生物菌的繁殖，菜農可根據自己土壤的情況加以改造，使生物菌在一個良好的土壤環境中“生活”。